ועד העמותה הוא הגוף המנהל של העמותה. כל סמכות וכח שלא הוקצו במפורש למוסד אחר בעמותה מסורים לוועד העמותה. תפקידו העיקרי של הוועד הוא קידום מטרותיה של העמותה ומימושן. על פי החלטת האסיפה הכללית הוועד המנהל כולל עד שבע חברות. הוועד המנהל קובע את נוהלי הישיבות. במהלך ישיבות הוועד המנהל, ראשות וועדות האמונות על הנושאים השונים באיגוד מעבירות דיווחים שוטפים על הפעילות במסגרת הועדות השונות. 

הוועד המנהל פועל בהתנדבות, ומתוך אמונה במטרות העמותה. החלטות הוועד המנהל מתקבלות באופן דמוקרטי בישיבות הוועד. יש מקום לדעות שונות ויחד עם זה, משהתקבלה החלטה על ידי חברות הוועד, גם אם מנוגדת לדעת חלקן, כולן מתגייסות ליישום ההחלטה בהתאם לתחום אחריותן. בהנהלת האיגוד יש מקום למתנדבות שאינן חברות הוועד המנהל באופן רשמי. הדלת פתוחה לכל שחקנית שרוצה לתת כתף ולתמוך בפעילות האיגוד וכן להציע רעיונות חדשים ולפעול למימושם